Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USF1P22415 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USF1P22415 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF1P22415 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms