Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD8BP10966 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD8BP10966 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 497.6 ms