Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HOXD4P09016 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXD4P09016 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms