Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGAVP06756 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms