Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPRP00739 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPRP00739 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPRP00739 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPRP00739 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPRP00739 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPRP00739 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPRP00739 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPRP00739 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPRP00739 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPRP00739 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPRP00739 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPRP00739 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HPRP00739 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HPRP00739 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms