Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms