Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SELENOFO60613 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms