Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUX1O43812 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUX1O43812 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUX1O43812 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX1O43812 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX1O43812 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX1O43812 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX1O43812 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX1O43812 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUX1O43812 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms