Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TSPAN4O14817 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TSPAN4O14817 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TSPAN4O14817 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TSPAN4O14817 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TSPAN4O14817 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TSPAN4O14817 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN4O14817 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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