Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CUX2O14529 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUX2O14529 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUX2O14529 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUX2O14529 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUX2O14529 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUX2O14529 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUX2O14529 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUX2O14529 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUX2O14529 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUX2O14529 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUX2O14529 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUX2O14529 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUX2O14529 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUX2O14529 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUX2O14529 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUX2O14529 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUX2O14529 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUX2O14529 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUX2O14529 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUX2O14529 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUX2O14529 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUX2O14529 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUX2O14529 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUX2O14529 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUX2O14529 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUX2O14529 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUX2O14529 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUX2O14529 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUX2O14529 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CUX2O14529 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CUX2O14529 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CUX2O14529 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CUX2O14529 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUX2O14529 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUX2O14529 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUX2O14529 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUX2O14529 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUX2O14529 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUX2O14529 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUX2O14529 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUX2O14529 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUX2O14529 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUX2O14529 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CUX2O14529 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms