Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP17L12C9JPN9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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USP17L12C9JPN9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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USP17L12C9JPN9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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USP17L12C9JPN9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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USP17L12C9JPN9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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USP17L12C9JPN9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USP17L12C9JPN9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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