Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms