Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms