Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms