Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MTMR11A4FU01 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms