Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms