Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G0

PCDHGB5, Protocadherin gamma-B5, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB5Q9Y5G0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHGB5Q9Y5G0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms