Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC2Q9Y2U9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC2Q9Y2U9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC2Q9Y2U9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms