Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPS3Q9UNS2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS3Q9UNS2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COPS3Q9UNS2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
COPS3Q9UNS2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
COPS3Q9UNS2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
COPS3Q9UNS2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPS3Q9UNS2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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