Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DKK2Q9UBU2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DKK2Q9UBU2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DKK2Q9UBU2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms