Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC3Q9NQT5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC3Q9NQT5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC3Q9NQT5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXOSC3Q9NQT5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC3Q9NQT5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC3Q9NQT5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC3Q9NQT5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC3Q9NQT5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC3Q9NQT5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC3Q9NQT5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC3Q9NQT5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC3Q9NQT5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC3Q9NQT5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC3Q9NQT5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC3Q9NQT5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC3Q9NQT5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC3Q9NQT5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms