Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFRSF12AQ9NP84 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFRSF12AQ9NP84 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFRSF12AQ9NP84 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms