Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIN28AQ9H9Z2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms