Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM55Q9BYV6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM55Q9BYV6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms