Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FNDC11Q9BVV2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNDC11Q9BVV2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC11Q9BVV2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms