Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF559Q9BR84 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF559Q9BR84 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF559Q9BR84 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms