Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep41Q99NF3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep41Q99NF3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep41Q99NF3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms