Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CRBNQ96SW2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CRBNQ96SW2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CRBNQ96SW2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CRBNQ96SW2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms