Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RILPQ96NA2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RILPQ96NA2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms