Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PCMTD1Q96MG8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCMTD1Q96MG8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCMTD1Q96MG8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCMTD1Q96MG8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms