Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBGCP3Q96CW5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP3Q96CW5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms