Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATL1Q8WXF7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATL1Q8WXF7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms