Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LNX2Q8N448 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LNX2Q8N448 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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