Protein–RNA interactions for Protein: Q86U17

SERPINA11, Serpin A11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA11Q86U17 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SERPINA11Q86U17 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SERPINA11Q86U17 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERPINA11Q86U17 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms