Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLX4IPQ5VYV7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLX4IPQ5VYV7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLX4IPQ5VYV7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms