Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGN3Q15651 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGN3Q15651 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMGN3Q15651 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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