Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 RPL12BYDR418W 498 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YFL012WYFL012W 447 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 ERV29YGR284C 933 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 EST3YIL009C-A 546 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YLR365WYLR365W 333 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 IES2YNL215W 963 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 SFT2YBL102W 648 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YSA1YBR111C 696 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 DCR2YLR361C 1737 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 JHD1YER051W 1479 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 RRI1YDL216C 1323 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YER137CYER137C 447 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YHR033WYHR033W 1272 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 GCV3YAL044C 513 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 PET10YKR046C 852 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 SEC65YML105C 822 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YNL217WYNL217W 981 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 NTG2YOL043C 1143 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 DAP1YPL170W 459 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 EFM2YBR271W 1260 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 PTM1YKL039W 1572 nt6.85□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 PRB1YEL060C 1908 nt6.84□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 CDC23YHR166C 1881 nt6.84□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 TCB1YOR086C 3561 nt6.84□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YDL119CYDL119C 924 nt6.84□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 PPE1YHR075C 1203 nt6.84□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 NAP1YKR048C 1254 nt6.84□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 SRL4YPL033C 846 nt6.84□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YPR177CYPR177C 372 nt6.84□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 PMA2YPL036W 2844 nt6.84□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 HNM1YGL077C 1692 nt6.84□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 YDL026WYDL026W 312 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 BUD26YDR241W 288 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 YDR401WYDR401W 564 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 GTS1YGL181W 1191 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 PEF1YGR058W 1008 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 MRPL25YGR076C 474 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 RHO3YIL118W 696 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 YJL043WYJL043W 774 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 PMU1YKL128C 888 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 BXI1YNL305C 894 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 SEC24YIL109C 2781 nt6.83□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 ATG32YIL146C 1590 nt6.82□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 TPI1YDR050C 747 nt6.82□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 NMA2YGR010W 1188 nt6.82□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 URA4YLR420W 1095 nt6.82□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 RMD8YFR048W 1989 nt6.81□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 ERG25YGR060W 930 nt6.81□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 CCE1YKL011C 1062 nt6.81□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 YAL066WYAL066W 309 nt6.81□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 YLR402WYLR402W 192 nt6.81□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 VMA6YLR447C 1038 nt6.81□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 YNL174WYNL174W 573 nt6.81□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 TOD6YBL054W 1578 nt6.81□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 SSU1YPL092W 1377 nt6.81□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 PCI8YIL071C 1335 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 YCR100CYCR100C 951 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 YDR215CYDR215C 414 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 YJR084WYJR084W 1272 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 CAR2YLR438W 1275 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 RTC4YNL254C 1206 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 RPS6AYPL090C 711 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 TAH18YPR048W 1872 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 RPS6BYBR181C 711 nt6.8□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 YEF1YEL041W 1488 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 CKI1YLR133W 1749 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 CPR2YHR057C 618 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 YHC3YJL059W 1227 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 CDC8YJR057W 651 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 NCE103YNL036W 666 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 ELC1YPL046C 300 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 POC4YPL144W 447 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 YPR153WYPR153W 423 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 RTC2YBR147W 891 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 DHH1YDL160C 1521 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 CIT3YPR001W 1461 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 ADE2YOR128C 1716 nt6.79□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 FLC2YAL053W 2352 nt6.78□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 SCL1YGL011C 759 nt6.78□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 YMR206WYMR206W 942 nt6.78□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 MAM3YOL060C 2121 nt6.78□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 RRP36YOR287C 903 nt6.78□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 HAL1YPR005C 885 nt6.78□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 YPR027CYPR027C 834 nt6.78□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 FCY1YPR062W 477 nt6.78□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 LOA1YPR139C 903 nt6.78□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 BSC5YNR069C 1470 nt6.78□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 MSS51YLR203C 1311 nt6.77□□□□□ -1.32
TY1A-NL1Q12391 SNU66YOR308C 1764 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 CTF3YLR381W 2202 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 SLI1YGR212W 1407 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 CNM67YNL225C 1746 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 YER156CYER156C 1017 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 KXD1YGL079W 657 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 URA5YML106W 681 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 ATO2YNR002C 849 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 RAS1YOR101W 930 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 YPC1YBR183W 951 nt6.77□□□□□ -1.33
TY1A-NL1Q12391 PEX19YDL065C 1029 nt6.76□□□□□ -1.33
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