Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 YDR514CYDR514C 1452 nt8.49□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 YDL027CYDL027C 1263 nt8.48□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 PPH21YDL134C 1110 nt8.48□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 ATC1YDR184C 885 nt8.48□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 MNN10YDR245W 1182 nt8.48□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 PRE1YER012W 597 nt8.48□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 DMC1YER179W 1005 nt8.48□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 TFG2YGR005C 1203 nt8.48□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 CKB2YOR039W 777 nt8.48□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 TRS31YDR472W 852 nt8.47□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 GIM4YEL003W 336 nt8.47□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.47□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 YJR149WYJR149W 1215 nt8.47□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 SRP21YKL122C 504 nt8.47□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 ATG16YMR159C 453 nt8.47□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 YJR124CYJR124C 1347 nt8.47□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 MEX67YPL169C 1800 nt8.47□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 SLS1YLR139C 1932 nt8.46□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 YHR131CYHR131C 2553 nt8.46□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 RIT1YMR283C 1542 nt8.46□□□□□ -1.05
TFB4Q12004 IRC22YEL001C 678 nt8.46□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 ERV14YGL054C 417 nt8.46□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 IPI1YHR085W 1005 nt8.46□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 MND2YIR025W 1107 nt8.46□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 ALB1YJL122W 528 nt8.46□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 DLT1YMR126C 1029 nt8.46□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 SME1YOR159C 285 nt8.46□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 IPL1YPL209C 1104 nt8.46□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 ATP20YPR020W 348 nt8.46□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 MET16YPR167C 786 nt8.46□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 RPL21AYBR191W 483 nt8.46□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 YPK3YBR028C 1578 nt8.46□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 TAT2YOL020W 1779 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 YDR455CYDR455C 309 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 SOD2YHR008C 702 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 IMD1YAR073W 1212 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 ERG6YML008C 1152 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 TOM40YMR203W 1164 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 TRM10YOL093W 882 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 YPL191CYPL191C 1083 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 PWR1PWR1 941 nt8.45□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 UPS3YDR185C 540 nt8.44□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 HST4YDR191W 1113 nt8.44□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 SPT3YDR392W 1014 nt8.44□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 ADE8YDR408C 645 nt8.44□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 AIM25YJR100C 984 nt8.44□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 FSH2YMR222C 672 nt8.44□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 MTF1YMR228W 1026 nt8.44□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 CYT1YOR065W 930 nt8.44□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 QDR2YIL121W 1629 nt8.43□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 GMC2YLR445W 567 nt8.43□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 WTM1YOR230W 1314 nt8.43□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 CEG1YGL130W 1380 nt8.43□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 DBP5YOR046C 1449 nt8.43□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 CIT3YPR001W 1461 nt8.43□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 YDL162CYDL162C 357 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 YHB1YGR234W 1200 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 COX2Q0250 756 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 NAS2YIL007C 663 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 RCN1YKL159C 636 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 RRT7YLL030C 342 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 MHT1YLL062C 975 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 YLR156WYLR156W 345 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 YLR159WYLR159W 345 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 YLR161WYLR161W 345 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 MFT1YML062C 1179 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 HIS3YOR202W 663 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 SRO9YCL037C 1305 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 DIG1YPL049C 1359 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 MAK11YKL021C 1407 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 PMT2YAL023C 2280 nt8.42□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 HST1YOL068C 1512 nt8.41□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 ERG13YML126C 1476 nt8.41□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 SAM50YNL026W 1455 nt8.41□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 SWM1YDR260C 513 nt8.41□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 PEX14YGL153W 1026 nt8.41□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 YKL123WYKL123W 381 nt8.41□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 YKR045CYKR045C 552 nt8.41□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 TAF3YPL011C 1062 nt8.41□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 CKS1YBR135W 453 nt8.41□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 POP2YNR052C 1302 nt8.4□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 COBQ0105 1158 nt8.4□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 PTI1YGR156W 1278 nt8.4□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 SDS3YIL084C 984 nt8.4□□□□□ -1.06
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