Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKCDQ05655 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCDQ05655 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCDQ05655 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCDQ05655 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms