Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMX2Q04743 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMX2Q04743 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms