Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 SIT1YEL065W 1887 nt5.71□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 GTT3YEL017W 1014 nt5.71□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 GCG1YER163C 699 nt5.71□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 COS6YGR295C 1146 nt5.71□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 YLR184WYLR184W 348 nt5.71□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 PEX13YLR191W 1161 nt5.71□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 YPL136WYPL136W 369 nt5.71□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 ECM2YBR065C 1095 nt5.71□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 LDB19YOR322C 2457 nt5.71□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 PXL1YKR090W 2121 nt5.71□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 CYC8YBR112C 2901 nt5.71□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 SNF11YDR073W 510 nt5.7□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 TRP5YGL026C 2124 nt5.7□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 HEM2YGL040C 1029 nt5.7□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.7□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 CBR1YIL043C 855 nt5.7□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 GCN3YKR026C 918 nt5.7□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 YBL112CYBL112C 318 nt5.7□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 CSC1YLR241W 2349 nt5.7□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 NOG2YNR053C 1461 nt5.7□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 HXT2YMR011W 1626 nt5.7□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 PMT3YOR321W 2262 nt5.69□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 YGL072CYGL072C 360 nt5.69□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 YJR107WYJR107W 987 nt5.69□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 MDH1YKL085W 1005 nt5.69□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 SWD1YAR003W 1281 nt5.69□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 YHM2YMR241W 945 nt5.69□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 IMA2YOL157C 1770 nt5.69□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 ECM7YLR443W 1347 nt5.69□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 GEF1YJR040W 2340 nt5.68□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 YKL077WYKL077W 1179 nt5.68□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 RPL31BYLR406C 342 nt5.68□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 HEM1YDR232W 1647 nt5.67□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 SEC18YBR080C 2277 nt5.67□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 SPG1YGR236C 288 nt5.67□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 YSC83YHR017W 1158 nt5.67□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.67□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 RNH1YMR234W 1047 nt5.67□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 YMR252CYMR252C 405 nt5.67□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 SEC62YPL094C 825 nt5.67□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 ARO7YPR060C 771 nt5.67□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 SES1YDR023W 1389 nt5.67□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 PCS60YBR222C 1632 nt5.66□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.66□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 OM45YIL136W 1182 nt5.66□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 YKL102CYKL102C 306 nt5.66□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 YKR032WYKR032W 315 nt5.66□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 DRE2YKR071C 1047 nt5.66□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 RDL1YOR285W 420 nt5.66□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 ADH5YBR145W 1056 nt5.66□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 POP1YNL221C 2628 nt5.66□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 GUS1YGL245W 2127 nt5.66□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 ERG8YMR220W 1356 nt5.66□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 ASN1YPR145W 1719 nt5.65□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 DDC1YPL194W 1839 nt5.65□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 VMS1YDR049W 1899 nt5.65□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 YDL177CYDL177C 513 nt5.65□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 TMA46YOR091W 1038 nt5.65□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 YBR027CYBR027C 333 nt5.65□□□□□ -1.5
SKO1Q02100 YMR155WYMR155W 1644 nt5.65□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 YMR034CYMR034C 1305 nt5.65□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 NTE1YML059C 5040 nt5.65□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 STT3YGL022W 2157 nt5.65□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 RIO1YOR119C 1455 nt5.64□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 RGD1YBR260C 2001 nt5.64□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 ADK2YER170W 678 nt5.64□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 SOH1YGL127C 384 nt5.64□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 YGR127WYGR127W 939 nt5.64□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.64□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 HAL1YPR005C 885 nt5.64□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 PRP40YKL012W 1752 nt5.64□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 DUG1YFR044C 1446 nt5.64□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 HED1YDR014W-A 489 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 CDC34YDR054C 888 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 YDR415CYDR415C 1125 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 YKR073CYKR073C 321 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 TSR2YLR435W 618 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 CUE4YML101C 354 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 YML131WYML131W 1098 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 DOM34YNL001W 1161 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 CDS1YBR029C 1374 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 PFK2YMR205C 2880 nt5.63□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 DOT1YDR440W 1749 nt5.62□□□□□ -1.51
SKO1Q02100 THI4YGR144W 981 nt5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.4 ms