Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTBP2P56545 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTBP2P56545 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms