Protein–RNA interactions for Protein: P53044

UFD1, Ubiquitin fusion degradation protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFD1P53044 TAF9YMR236W 474 nt5.57□□□□□ -1.52
UFD1P53044 RKI1YOR095C 777 nt5.57□□□□□ -1.52
UFD1P53044 PDR18YNR070W 4002 nt5.57□□□□□ -1.52
UFD1P53044 YMR279CYMR279C 1623 nt5.56□□□□□ -1.52
UFD1P53044 HDA1YNL021W 2121 nt5.56□□□□□ -1.52
UFD1P53044 GEP5YLR091W 882 nt5.56□□□□□ -1.52
UFD1P53044 OGG1YML060W 1131 nt5.56□□□□□ -1.52
UFD1P53044 MRPS18YNL306W 654 nt5.56□□□□□ -1.52
UFD1P53044 LSC1YOR142W 990 nt5.56□□□□□ -1.52
UFD1P53044 HAS1YMR290C 1518 nt5.55□□□□□ -1.52
UFD1P53044 LCL3YGL085W 825 nt5.55□□□□□ -1.52
UFD1P53044 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.55□□□□□ -1.52
UFD1P53044 AIM24YJR080C 1185 nt5.55□□□□□ -1.52
UFD1P53044 YAR064WYAR064W 300 nt5.55□□□□□ -1.52
UFD1P53044 GPB2YAL056W 2643 nt5.55□□□□□ -1.52
UFD1P53044 CCC2YDR270W 3015 nt5.54□□□□□ -1.52
UFD1P53044 VPS61YDR136C 573 nt5.54□□□□□ -1.52
UFD1P53044 FZF1YGL254W 900 nt5.54□□□□□ -1.52
UFD1P53044 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.54□□□□□ -1.52
UFD1P53044 AIM20YIL158W 615 nt5.54□□□□□ -1.52
UFD1P53044 RHO4YKR055W 876 nt5.54□□□□□ -1.52
UFD1P53044 COQ3YOL096C 939 nt5.54□□□□□ -1.52
UFD1P53044 SCT1YBL011W 2280 nt5.54□□□□□ -1.52
UFD1P53044 IMG1YCR046C 510 nt5.53□□□□□ -1.52
UFD1P53044 COX9YDL067C 180 nt5.53□□□□□ -1.52
UFD1P53044 TIM22YDL217C 624 nt5.53□□□□□ -1.52
UFD1P53044 MRPL1YDR116C 858 nt5.53□□□□□ -1.52
UFD1P53044 GPI11YDR302W 660 nt5.53□□□□□ -1.52
UFD1P53044 SPG1YGR236C 288 nt5.53□□□□□ -1.52
UFD1P53044 LYS1YIR034C 1122 nt5.53□□□□□ -1.52
UFD1P53044 MDE1YJR024C 735 nt5.53□□□□□ -1.52
UFD1P53044 YML6YML025C 861 nt5.53□□□□□ -1.52
UFD1P53044 CTF19YPL018W 1110 nt5.53□□□□□ -1.52
UFD1P53044 TKL1YPR074C 2043 nt5.53□□□□□ -1.52
UFD1P53044 GEX1YCL073C 1848 nt5.53□□□□□ -1.52
UFD1P53044 GEX2YKR106W 1848 nt5.53□□□□□ -1.52
UFD1P53044 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.52□□□□□ -1.53
UFD1P53044 RUF23RUF23 254 nt5.52□□□□□ -1.53
UFD1P53044 YPL136WYPL136W 369 nt5.52□□□□□ -1.53
UFD1P53044 LDB16YCL005W 771 nt5.52□□□□□ -1.53
UFD1P53044 FAT3YKL187C 2253 nt5.51□□□□□ -1.53
UFD1P53044 YGR054WYGR054W 1929 nt5.51□□□□□ -1.53
UFD1P53044 ARE2YNR019W 1929 nt5.51□□□□□ -1.53
UFD1P53044 VMA3YEL027W 483 nt5.51□□□□□ -1.53
UFD1P53044 GCG1YER163C 699 nt5.51□□□□□ -1.53
UFD1P53044 OM45YIL136W 1182 nt5.51□□□□□ -1.53
UFD1P53044 CCT8YJL008C 1707 nt5.51□□□□□ -1.53
UFD1P53044 SAL1YNL083W 1485 nt5.51□□□□□ -1.53
UFD1P53044 PRY3YJL078C 2646 nt5.5□□□□□ -1.53
UFD1P53044 YHC3YJL059W 1227 nt5.5□□□□□ -1.53
UFD1P53044 AFG1YEL052W 1530 nt5.49□□□□□ -1.53
UFD1P53044 PGM1YKL127W 1713 nt5.49□□□□□ -1.53
UFD1P53044 OAC1YKL120W 975 nt5.49□□□□□ -1.53
UFD1P53044 PSR2YLR019W 1194 nt5.49□□□□□ -1.53
UFD1P53044 YOR300WYOR300W 309 nt5.49□□□□□ -1.53
UFD1P53044 YDR514CYDR514C 1452 nt5.49□□□□□ -1.53
UFD1P53044 YKR023WYKR023W 1593 nt5.49□□□□□ -1.53
UFD1P53044 ALT1YLR089C 1779 nt5.49□□□□□ -1.53
UFD1P53044 MTC5YDR128W 3447 nt5.49□□□□□ -1.53
UFD1P53044 SGV1YPR161C 1974 nt5.48□□□□□ -1.53
UFD1P53044 MSS1YMR023C 1581 nt5.48□□□□□ -1.53
UFD1P53044 PMP3YDR276C 168 nt5.48□□□□□ -1.53
UFD1P53044 OPI7YDR360W 435 nt5.48□□□□□ -1.53
UFD1P53044 BSC4YNL269W 396 nt5.48□□□□□ -1.53
UFD1P53044 MSO1YNR049C 633 nt5.48□□□□□ -1.53
UFD1P53044 YPL041CYPL041C 624 nt5.48□□□□□ -1.53
UFD1P53044 ECM31YBR176W 939 nt5.48□□□□□ -1.53
UFD1P53044 PFK2YMR205C 2880 nt5.48□□□□□ -1.53
UFD1P53044 IMA2YOL157C 1770 nt5.47□□□□□ -1.53
UFD1P53044 ATF1YOR377W 1578 nt5.47□□□□□ -1.53
UFD1P53044 POR2YIL114C 846 nt5.47□□□□□ -1.53
UFD1P53044 QCR8YJL166W 285 nt5.47□□□□□ -1.53
UFD1P53044 MEH1YKR007W 555 nt5.47□□□□□ -1.53
UFD1P53044 SRL2YLR082C 1179 nt5.47□□□□□ -1.53
UFD1P53044 ARA2YMR041C 1008 nt5.47□□□□□ -1.53
UFD1P53044 SCS22YBL091C-A 528 nt5.47□□□□□ -1.53
UFD1P53044 ILV6YCL009C 930 nt5.47□□□□□ -1.53
UFD1P53044 HSP104YLL026W 2727 nt5.47□□□□□ -1.53
UFD1P53044 GPD2YOL059W 1323 nt5.47□□□□□ -1.53
UFD1P53044 EMW1YNL313C 2715 nt5.46□□□□□ -1.53
UFD1P53044 ERG8YMR220W 1356 nt5.46□□□□□ -1.54
UFD1P53044 COX20YDR231C 618 nt5.46□□□□□ -1.54
UFD1P53044 RNR3YIL066C 2610 nt5.46□□□□□ -1.54
UFD1P53044 YKL153WYKL153W 510 nt5.45□□□□□ -1.54
UFD1P53044 MHT1YLL062C 975 nt5.45□□□□□ -1.54
UFD1P53044 ICT1YLR099C 1185 nt5.45□□□□□ -1.54
UFD1P53044 GTO3YMR251W 1101 nt5.45□□□□□ -1.54
UFD1P53044 CPA1YOR303W 1236 nt5.45□□□□□ -1.54
UFD1P53044 PTC4YBR125C 1182 nt5.45□□□□□ -1.54
UFD1P53044 LCB3YJL134W 1230 nt5.44□□□□□ -1.54
UFD1P53044 YKR045CYKR045C 552 nt5.44□□□□□ -1.54
UFD1P53044 TSR2YLR435W 618 nt5.44□□□□□ -1.54
UFD1P53044 IES2YNL215W 963 nt5.44□□□□□ -1.54
UFD1P53044 FLC3YGL139W 2409 nt5.43□□□□□ -1.54
UFD1P53044 TFG2YGR005C 1203 nt5.43□□□□□ -1.54
UFD1P53044 KTR1YOR099W 1182 nt5.43□□□□□ -1.54
UFD1P53044 RPS28AYOR167C 204 nt5.43□□□□□ -1.54
UFD1P53044 YPR123CYPR123C 435 nt5.43□□□□□ -1.54
UFD1P53044 GPT2YKR067W 2232 nt5.43□□□□□ -1.54
UFD1P53044 MRS1YIR021W 1092 nt5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms