Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX5P50542 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX5P50542 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX5P50542 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX5P50542 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX5P50542 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX5P50542 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX5P50542 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX5P50542 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX5P50542 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX5P50542 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PEX5P50542 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX5P50542 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX5P50542 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX5P50542 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX5P50542 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX5P50542 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX5P50542 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX5P50542 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX5P50542 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX5P50542 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX5P50542 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX5P50542 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX5P50542 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX5P50542 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX5P50542 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX5P50542 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX5P50542 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX5P50542 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX5P50542 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX5P50542 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX5P50542 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX5P50542 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX5P50542 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX5P50542 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX5P50542 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX5P50542 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX5P50542 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX5P50542 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX5P50542 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX5P50542 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX5P50542 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX5P50542 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX5P50542 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX5P50542 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX5P50542 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX5P50542 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX5P50542 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX5P50542 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX5P50542 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX5P50542 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX5P50542 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX5P50542 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX5P50542 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX5P50542 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX5P50542 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX5P50542 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX5P50542 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX5P50542 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX5P50542 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX5P50542 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX5P50542 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX5P50542 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX5P50542 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX5P50542 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX5P50542 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX5P50542 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX5P50542 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX5P50542 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX5P50542 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX5P50542 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX5P50542 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX5P50542 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX5P50542 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX5P50542 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX5P50542 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX5P50542 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX5P50542 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX5P50542 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX5P50542 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX5P50542 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX5P50542 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX5P50542 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX5P50542 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX5P50542 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX5P50542 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX5P50542 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX5P50542 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX5P50542 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX5P50542 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX5P50542 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX5P50542 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX5P50542 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX5P50542 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX5P50542 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX5P50542 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX5P50542 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX5P50542 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX5P50542 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX5P50542 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms