Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC5P28715 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC5P28715 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERCC5P28715 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms