Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNA2P26232 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTNNA2P26232 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms