Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFRSF1BP20333 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF1BP20333 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF1BP20333 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms