Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNT1P13805 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNT1P13805 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNT1P13805 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNT1P13805 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms