Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLUP10909 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLUP10909 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLUP10909 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLUP10909 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLUP10909 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLUP10909 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLUP10909 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLUP10909 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLUP10909 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLUP10909 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLUP10909 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLUP10909 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLUP10909 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLUP10909 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLUP10909 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLUP10909 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLUP10909 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLUP10909 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLUP10909 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLUP10909 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLUP10909 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLUP10909 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLUP10909 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLUP10909 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLUP10909 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLUP10909 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLUP10909 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLUP10909 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLUP10909 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLUP10909 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLUP10909 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLUP10909 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLUP10909 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLUP10909 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLUP10909 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLUP10909 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CLUP10909 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLUP10909 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLUP10909 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLUP10909 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLUP10909 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLUP10909 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLUP10909 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLUP10909 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLUP10909 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLUP10909 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLUP10909 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLUP10909 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLUP10909 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLUP10909 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLUP10909 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLUP10909 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLUP10909 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLUP10909 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLUP10909 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLUP10909 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLUP10909 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLUP10909 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLUP10909 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLUP10909 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLUP10909 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLUP10909 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLUP10909 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLUP10909 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLUP10909 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLUP10909 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLUP10909 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLUP10909 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLUP10909 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLUP10909 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLUP10909 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLUP10909 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLUP10909 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLUP10909 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLUP10909 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLUP10909 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLUP10909 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLUP10909 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLUP10909 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLUP10909 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLUP10909 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLUP10909 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLUP10909 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLUP10909 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLUP10909 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLUP10909 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLUP10909 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLUP10909 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLUP10909 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLUP10909 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLUP10909 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLUP10909 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLUP10909 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLUP10909 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLUP10909 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLUP10909 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLUP10909 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLUP10909 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLUP10909 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms