Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z6

TFPT, TCF3 fusion partner, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFPTP0C1Z6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFPTP0C1Z6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFPTP0C1Z6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFPTP0C1Z6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFPTP0C1Z6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFPTP0C1Z6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFPTP0C1Z6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFPTP0C1Z6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFPTP0C1Z6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFPTP0C1Z6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFPTP0C1Z6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFPTP0C1Z6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TFPTP0C1Z6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFPTP0C1Z6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFPTP0C1Z6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFPTP0C1Z6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFPTP0C1Z6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TFPTP0C1Z6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TFPTP0C1Z6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFPTP0C1Z6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms